В ходе экспериментов установил следующее - патчить программу надо из под MacOS 10.4. (в 10.5 или 10.6 патчер не работает, 10.3 не пробовал)
В итоге, как сделать, чтобы заработала на 10.6:
1.устанавливаем дистрибутив на 10.6 (ни в коем случае не пытаемся запустить непропатченную программу!)
2.устанавливаем дистрибутив на другой винт с системой 10.4
3.запускаемся из под 10.4 и патчим прогу.
4. ищем в папке Application программу и заменяем ею ту, что находится на харддиске с 10.6
5. Вуаля!
Возможно можно сделать проще - но я не пробовал - скопировать установленный файл программы в систему 10.4, там его пропатчить, потом вернуть обратно (без установки дистрибутива в 10.4).