TeraChem 1.93P x64 [2017, ENG]

Страницы:  1
Ответить
 

Mizuchi

Стаж: 15 лет 6 месяцев

Сообщений: 415


Mizuchi · 17-Апр-19 19:50 (6 лет 3 месяца назад, ред. 23-Май-20 20:37)

TeraChem
Год/Дата Выпуска: 2017
Версия: 1.93P
Разработчик: PetaChem
Сайт разработчика: petachem.com/products.html
Разрядность: 64bit
Язык интерфейса: Английский
Таблэтка: не требуется
Системные требования: GNU/Linux x86_64, GPU of the Pascal generation
Описание: TeraChem - это программное обеспечение для квантовой химии общего назначения, предназначенное для работы на графических процессорах NVIDIA под 64-разрядной операционной системой GNU/Linux. Некоторые функции TeraChem:
• RHF, UHF, ROHF
• TDDFT, CIS
• Полная поддержка GTO s, p и d-типа и ECP с угловым моментом до L = 4.
• Различные функционалы DFT: BLYP, B3LYP, PBE, PBE0, ωPBE, ωPBEh, ωB97, ωB97x, camB3LYP и т.д. + коррекция Гримме
• Сольватные модели
• Оптимизация геометрии (L-BFGS, CG, SD)
• Поиск состояния перехода (Nudged Elastic Band) во внутренних и декартовых координатах
• Молекулярная динамика от первых принципов (NVE, NVT ансамбли)
• QMMM обработка молекул воды
• Анализ естественных орбиталей в интеграции с NBO6
• До 16 графических процессоров на рабочую станцию
Обновление от 23 мая 2020: довзломана проверка лицензии, просьба перекачать.
Скриншоты
Download
Rutracker.org не распространяет и не хранит электронные версии произведений, а лишь предоставляет доступ к создаваемому пользователями каталогу ссылок на торрент-файлы, которые содержат только списки хеш-сумм
Как скачивать? (для скачивания .torrent файлов необходима регистрация)
[Профиль]  [ЛС] 

Mizuchi

Стаж: 15 лет 6 месяцев

Сообщений: 415


Mizuchi · 19-Апр-19 12:25 (спустя 1 день 16 часов, ред. 19-Апр-19 12:25)

Релиз для тех, кому хочется на Паскалях считать. Видимо, TeraChem 2.0 так и не выпустят.
Заранее отвечая на вопросы:
1) Нет, ни на чем позднее Паскалей работать не будет.
2) Если глючит, отваливаются библиотеки и крашатся расчеты -- я предупреждал.
3) Релиз не соответствует официальному, кое-что переделано, поэтому контрольные суммы не будут совпадать.
4) На ноутбуках лучше не пытаться считать. Ноутбук -- недокомпьютер, возьмите лучше GTX Titan + AMD FX с Авито и будьте счастливы. Или Xeon с Aliexpress, тогда эта помойка будет способна считать что-то тяжелее бензола в 3-21G.
5) Читайте гайд из раздачи, там много полезной инфы.
6) НЕ РЕКОМЕНДУЕТСЯ использовать 1.93P с видеокартами, поколение которых отлично от Паскаль. Причины см. выше. Для остальных поколений есть эта раздача.
[Профиль]  [ЛС] 

Lariwin

Стаж: 12 лет 7 месяцев

Сообщений: 3


Lariwin · 18-Май-19 18:00 (спустя 29 дней)

Добрый день. Все работает. Большое спасибо за раздачу:)
Моя система:
nvidia 1060 - 3 Gb
intel core i3 - 4150.
ОЗУ - 8 Gb.
Производительность при расчете энергии в точке:
олестра - 595c (277c для 1080ti) - BLYP/6-31G* и 344c (175c для 1080ti) - RHF/6-31G*
валиномицин - 93с (55с для 1080ti) - BLYP/6-31G* и 88c (56c для 1080ti) - RHF/6-31G*
таксол - 80с (47с для 1080ti) - BLYP/6-31G* и 51c (34c для 1080ti) - RHF/6-31G*
Только есть одна проблема: при расчете ИК-спектров программа выдает частоты колебаний без их интенсивностей. Это нормальное функционирование TeraChem или какой-то баг? Может дело в настройках?
Рабочий файл для расчета ИК:
# basis set: 6-31G
basis 6-311++g[2d,2p]
# coordinates file
coordinates DMDAAX-freq.xyz
# molecule charge
charge 0
# SCF method (rhf/blyp/b3lyp/etc...)
method b3lyp
# add dispersion correction (DFT-D)
dftd no
# type of the job (energy/gradient/md/minimize/ts/frequencies)
run frequencies
timings yes
# Need to set maxgradnorm so TeraChem will not complain that this geometry is not a minimum
maxgradnorm 1.0
# mincheck false tells TeraChem not to test the gradient norm before proceeding with frequency calculation
mincheck false
end
Заранее спасибо за ответы.
[Профиль]  [ЛС] 

thesyskokidd

Стаж: 9 лет 10 месяцев

Сообщений: 2


thesyskokidd · 07-Июн-19 09:25 (спустя 19 дней)

Hello Mizuchi! You are my hero. Thank you for sharing so much computational software. Is there any chance to ever get ADF computational suite? I have looked everywhere, but cannot find a copy
Also, CONFLEX is very amazing software for finding macrocycle ensembles. Thank you!
Привет Мizuchi! Ты мой герой. Спасибо, что поделились таким большим количеством вычислительного программного обеспечения. Есть ли шанс когда-нибудь получить вычислительный пакет ADF? Я посмотрел везде, но не могу найти копию
Кроме того, CONFLEX - отличное программное обеспечение для поиска ансамблей макроциклов. Спасибо!
[Профиль]  [ЛС] 

Mizuchi

Стаж: 15 лет 6 месяцев

Сообщений: 415


Mizuchi · 07-Июн-19 19:57 (спустя 10 часов)

thesyskokidd
Hi!
I'm glad to know my torrents are helpful for you. Regarding ADF it's almost impossible to get, I spent more than a year looking for that. Fortunately, ADF has no unique features which cannot be replaced by other software, so you can tell what exactly you want to compute with ADF and I will try to find an appropriate replacement.
I haven't heard about CONFLEX up to the time, and it's unlikely for me to find this quickly.
mizuchi
[Профиль]  [ЛС] 

SergKis64

Стаж: 11 лет 9 месяцев

Сообщений: 6


SergKis64 · 14-Май-20 10:08 (спустя 11 месяцев, ред. 14-Май-20 10:08)

Lariwin писал(а):
77393512Добрый день. Все работает. Большое спасибо за раздачу:)
---
Добрый день! Какая ОС?
У меня на Debian 9.9 не запускается terachem 1.93p, ищет то, чего нет.
Моя система:
nvidia 1060 - 6 Gb
intel Pentium.
ОЗУ - 64 Gb.
/proc/driver/nvidia/version
NVRM version: NVIDIA UNIX x86_64 Kernel Module 390.116 Sun Jan 27 07:21:36 PST 2019
GCC version: gcc version 6.3.0 20170516 (Debian 6.3.0-18+deb9u1)
root@deb99-3:/var/opt/TeraChem# bin/terachem -h
bin/terachem: error while loading shared libraries: libcurl.so.4: cannot open shared object file: No such file or directory
Пробовал на Debian 8 и 9 установить отдельно "libcurl4",- не удается, зависимости не такие, как надо.
[Профиль]  [ЛС] 

Mizuchi

Стаж: 15 лет 6 месяцев

Сообщений: 415


Mizuchi · 14-Май-20 10:17 (спустя 9 мин.)

SergKis64
Эх, придется компилировать. Умеешь или сказать, как это делается?
[Профиль]  [ЛС] 

SergKis64

Стаж: 11 лет 9 месяцев

Сообщений: 6


SergKis64 · 17-Май-20 17:54 (спустя 3 дня, ред. 17-Май-20 17:54)

Mizuchi писал(а):
79439185SergKis64
Эх, придется компилировать. Умеешь или сказать, как это делается?
---
Добрый день!
На Фортране (Intel) компилировал лет 10 назад, адаптировал старую прогу.
Если подскажете вкратце, попробую.
Спасибо.
Mizuchi
На какой ОС, кроме Red Hat 6 (6.8), заработает terachem(tc) 1.93p?
Open SUSE 11, 12? Пусть криво, но заработает?
Конечно, лучше прибарахлиться на авито, купить 980ti и спокойно считать на tc1.91.
Но жаба душит, ведь GTX 1060 6 Gb была куплена с расчетом на tc.
[Профиль]  [ЛС] 

Mizuchi

Стаж: 15 лет 6 месяцев

Сообщений: 415


Mizuchi · 17-Май-20 19:40 (спустя 1 час 46 мин.)

SergKis64
У меня на Arch Linux работало. Пакет libcurl-dev установлен? Ага, зря 1060 покупали, лучше бы какой-нибудь Titan Maxwell или 980Ti.
[Профиль]  [ЛС] 

SergKis64

Стаж: 11 лет 9 месяцев

Сообщений: 6


SergKis64 · 17-Май-20 20:48 (спустя 1 час 7 мин.)

Mizuchi
Точно, зря.
Ладно, попробую еще разок на Arch или Red Hat
[Профиль]  [ЛС] 

SergKis64

Стаж: 11 лет 9 месяцев

Сообщений: 6


SergKis64 · 24-Май-20 07:20 (спустя 6 дней)

Mizuchi
Mizuchi, cпасибо за наводку, помогла.
Terachem 1.93p нормально заработал на debian 9.
Установил пакет "libssl-dev" на ОС debian 8,
затем скопировал недостающие файлы в локальный каталог Terachem/lib.
---------------------------------------
TeraChem 1.93p Pentium G4500 @3.5GHz посчитал валиномицин (SP, B3LYP/6-31g*) быстрей в 3.7 (четыре!!!) раза
по сравнению с гауссианом 16 на Ryzen 2700X @3.7 GHz
Почувсвуйте разницу, как говорится.
Startfile from command line: tests/valinomycin/C54N6H90O18.sp
---
# basis set: 6-31G*
basis 6-31gs
# coordinates file
coordinates work/valinomycin/C54N6H90O18.xyz
# molecule charge
charge 0
# SCF method (rhf/blyp/b3lyp/etc...)
method rb3lyp
# add dispersion correction (DFT-D)
dftd no
# type of the job (energy/gradient/md/minimize/ts): single-point energy
run energy
end
---
Job started Fri May 22 08:03:39 2020
On deb99-3 (available memory: 63086 MB)
...
FINAL ENERGY: -3794.7997408084 a.u.
...
Total processing time: 137.79 sec
Job finished: Fri May 22 08:06:00 2020
******************************************
Gaussian 16: ES64L-G16RevA.03 25-Dec-2016
18-Apr-2020
******************************************
-------------------
# sp b3lyp/6-31g(d)
Charge = 0 Multiplicity = 1
Stoichiometry C54H90N6O18
-------------------
Default is to use a total of 8 processors:
8 via shared-memory
1 via Linda
-------------------
Job cpu time: 0 days 1 hours 7 minutes 30.1 seconds.
Elapsed time: 0 days 0 hours 8 minutes 27.3 seconds.
-------------------
[Профиль]  [ЛС] 
 
Ответить
Loading...
Error